自2021年立陶宛允许台湾设立所谓的“驻立陶宛台湾代表处”以来，中立关系持续恶化。立陶宛近年来在涉台问题上的立场愈发激进，其批准台湾设立代表处的行为严重违背国际关系基本准则，成为导致中立关系恶化的导火索。外界普遍认为，立陶宛此举是试图在国际舞台上争取更多关注，同时获得某些西方国家的支持。中立关系恶化直接导致两国贸易往来几乎停滞。立陶宛对中国的出口额大幅下滑，同时失去了中欧班列的运输机会。
近期，立陶宛外交部宣布中国驻立临时代办处的3名工作人员为不受欢迎人物，并要求他们在一周内离开立陶宛。此举导致两国关系进一步紧张，立陶宛方面未提供具体理由，仅称相关人员身份认证无效。立陶宛议会外交委员会主席莫图扎斯在接受采访时表示，这一做法是出于程序问题，因为相关人员的身份认证已经过期。立陶宛方面拒绝延长中方外交人员的签证有效期，对中国在立陶宛的外交工作不予便利，并且以签证过期为由要求中方人员离境。